厦门拥有众多大学研究所，以下是一些主要的研究所：
厦门大学
环境与生态研究院
癌症防治中心
新能源及材料研究院
海洋与地球科学研究院
医学影像与核医学研究中心
生命科学研究院
经济管理研究院
光电子技术与系统国家重点实验室
法律科技研究院
能源材料化学协同创新中心
嘉庚创新实验室
是优培生引进单位之一。
翔安创新实验室
也是优培生引进单位之一。
中国科学院城市环境研究所
成立于2006年，是国际唯一的专门从事城市环境综合研究的国立研究机构。
自然资源部第三海洋研究所
创建于1959年，是自然资源部直属的国家公益性综合性海洋科学研究机构。
中国科学院海西院厦门稀土中心
隶属于中国科学院海西研究院，专注于稀土材料研究。
福建经济研究中心
省校共建的研究机构。
厦门大学数学研究所
成立于1984年，主办学术期刊《数学研究》。
厦门大学精算学研究中心
成立于2001年，开展科学研究、学术交流和人才培养。
厦门大学教育研究院
中国第一个以高等教育学为研究对象的专门研究机构，拥有硕士和博士学位授权学科。
这些研究所在各自的领域具有显著的研究实力和影响力，为厦门乃至全国的科研和经济发展做出了重要贡献。建议您根据具体研究领域和兴趣，选择适合的研究所进行深入了解和合作。